Ce séminaire sera entièrement consacré à la réflexion autour des CATI4G mais aussi à leurs liens au PEPI et à la Pépinière numérique. Il s’inscrit dans un processus global de réflexion sur la construction des CATI4G. D’ailleurs il sera précédé d’une enquête qui servira de matrice aux réflexions lors du séminaire. Ce processus est piloté […]

M. Bergevin de la société Itrium viendra nous parler du concept et de la mise en œuvre du refroidissement par immersion des datacenters. Un site utilisant cette technique est en cours de construction à Jouy-en-Josas.

Manque de précision pour l'instant.

Lundi après midi : Accueil café 14h - 14h30 14h30 - 14h40: intro avec présentation CATI (effectifs, budget depense de l’année, à venir CATI 4G) 10’ 14h40 - 14h50: Topo nouveaux arrivants : Julien Henry et Gabryelle Agoutin 10’ 14h50 - 15h35 : Laure Luno CNES - suivi balise bateau 30’+15’ 15h35 - 15h50: présentation […]

Présentation de Géraldine Pascal Surmonter les défis de l'affiliation taxonomique dans le séquençage du métabarcoding : tirer parti des longues lectures et de la stratégie d'affiliation à plusieurs bases de données

Présentation des différentes applications webs qui ont été récemment développées au sein du CATI, en se focalisant sur les aspects techniques du développement : Quelles technologies de développement pour quelle(s) raison(s). Les participants seront : - Céline : Asterics - Philippe Bordron : d-genies - Philippe Bardou : RumimiR / FishmiR / GEGA - Luc : […]

Présentation par Hugo Chauvet et Christophe Chevalier du synchrotron Soleil https://www.synchrotron-soleil.fr/fr

Aurélien Brionne nous présentera son pipeline Nextflow d’analyse des îlots CpG dans différentes branches de l’évolution phylogénétique.

Le 5 Mars à 14h, nous recevrons Olivier Ridoux de l'IRISA qui nous parlera de l'impact du numérique sur l'environnement.

Proposition de présentation de Jérémy Tournaire

Laurent Bréhélin nous présentera TFScope. Une approche de Machine Learning pour l'analyse des caractéristiques génomiques impliquées dans les préférences de liaison des facteurs de transcription

Pour notre visio du mois de Juin, nous invitons Arnaud Liehrmann  et Guillem Rigaill qui ont récemment publié le package R DiffSegR. Cet outil permet une analyse différentielle du transcriptome qui ne nécessite pas une définition génomique des bornes de gènes, exons, … Article NAR Genomics and Bioinformatics : https://doi.org/10.1093/nargab/lqad098 Lien Github : https://aliehrmann.github.io/DiffSegR/index.html