Présentation de Géraldine Pascal Surmonter les défis de l'affiliation taxonomique dans le séquençage du métabarcoding : tirer parti des longues lectures et de la stratégie d'affiliation à plusieurs bases de données

Présentation des différentes applications webs qui ont été récemment développées au sein du CATI, en se focalisant sur les aspects techniques du développement : Quelles technologies de développement pour quelle(s) raison(s). Les participants seront : - Céline : Asterics - Philippe Bordron : d-genies - Philippe Bardou : RumimiR / FishmiR / GEGA - Luc : […]

Présentation par Hugo Chauvet et Christophe Chevalier du synchrotron Soleil https://www.synchrotron-soleil.fr/fr

Aurélien Brionne nous présentera son pipeline Nextflow d’analyse des îlots CpG dans différentes branches de l’évolution phylogénétique.

Le 5 Mars à 14h, nous recevrons Olivier Ridoux de l'IRISA qui nous parlera de l'impact du numérique sur l'environnement.

Proposition de présentation de Jérémy Tournaire

Laurent Bréhélin nous présentera TFScope. Une approche de Machine Learning pour l'analyse des caractéristiques génomiques impliquées dans les préférences de liaison des facteurs de transcription

Pour notre visio du mois de Juin, nous invitons Arnaud Liehrmann  et Guillem Rigaill qui ont récemment publié le package R DiffSegR. Cet outil permet une analyse différentielle du transcriptome qui ne nécessite pas une définition génomique des bornes de gènes, exons, … Article NAR Genomics and Bioinformatics : https://doi.org/10.1093/nargab/lqad098 Lien Github : https://aliehrmann.github.io/DiffSegR/index.html

Dans le cadre de JOBIM 2024, le CATI BIOS4Biol organise le jeudi 27 juin 2024 le mini-symposium L'IA en sciences du vivant - impact sur nos métiers L’IA et plus particulièrement l’IA générative représente sans conteste un des évènements majeurs qui bouleverse et bouleversera nos métiers. La généralisation de l'accès à une multitude d'outils tels […]

Les Journées Annuelles du CATI BIOS4Biol 2024. Du lundi 30 septembre au mercredi 2 octobre, au programme: LUNDI - INRAE - Castanet Tolosan 14h30 - 14h40: mots de bienvenue et présentation "évolution du CATI" 14h40 - 14h55: présentation des nouveaux arrivants : Philippe Ruiz (mobilité), Gaetan Givry, Fabien Graziani (mobilité), Sandrine Laguerre. 15h00 - 15h45: “Analyse […]

Pour notre visio du mois de Novembre, nous invitons Jonathan Kreplak et Johan Joets qui nous parlerons de leur travaux  : "Les données d'annotation fonctionnelle, gestion et exploitation"

Pour notre visio du mois de Décembre, Gabrielle Agoutin nous parlera du projet "Taxon Marker"